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Autore Messaggio
MessaggioInviato: martedì 22 maggio 2018, 13:43 
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Iscritto il: martedì 7 luglio 2009, 10:48
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Gabriel81 ha scritto:
il lentivirus permette l’ingresso in tutte le cellule Tcd4 (latentemente infette e non) e le guide del cas9 si “attiverebbero” solo in presenza di provirus integrato nel genoma con sequenze REV e TAT riconosciute (e da qui il tema della selezione delle mutazioni di escape), quindi la vera difficoltà è nella costruzione delle guide “efficaci” che includano peri quanto piu conservative è possibile? Il Lentivirus utilizzato teoricamente penetra solo cd4 o potenzialmente anche le altre cellule coinvolte dall’infezione (tipo quei discutibili <edit automatico> dei macrofagi?) dall’articolo non sono riuscito a capire come fosse costruito?

Io credo che questo sia tutto molto teorico, dal momento che quando in vivo si riesce a modificare una quota attorno al 15% delle cellule bersaglio già si lanciano grida di giubilo. Inoltre, qui hanno lavorato solo sul reservoir più esteso, quello dei CD4. E soprattutto: la difficoltà di editare cellule in vivo non è neppure lontanamente paragonabile con quella di modificare cellule in coltura.
La costruzione del vettore va al di là delle mie forze! In ogni caso, la trovi al paragrafo Lentiviral vector construction and transduction dei Methods.

Cita:
Secondo te, se teoricamente dal paziente estraessi prima HIV-DNA integrato, chissà se si possa costruire le guide in maniera paziente specifica?(chiaro che sarebbe troppo costoso per farlo a tutti, ma pensavo per l’impostazione del trial)

Immagino di sì, ma il provirus archiviato nel reservoir non è necessariamente omogeneo, anche se poi una volta lì resta senza trascriversi. Quindi quello della personalizzazione degli RNA guida mi pare un lavoro davvero enorme, che per altro mi sembra possa essere evitato da un approccio come questo dei ricercatori della Kobe University, che hanno cercato di costruire i gRNA in modo da comprendere la maggior parte dei sottotipi di HIV-1.

Cita:
Potenzialmente sarebbe estendibile anche per una cura eradicante oltre che funzionale?

Per adesso ne dubito, perché il presupposto sarebbe di trovare tutte le cellule latentemente infette e distruggere tutti i provirus.


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MessaggioInviato: martedì 17 luglio 2018, 8:25 
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Iscritto il: martedì 7 luglio 2009, 10:48
Messaggi: 6354
La storia infinita dei possibili danni non intenzionali che le CRISPR possono indurre nel genoma vede oggi un nuovo capitolo, con la pubblicazione su Nature Biotechnology di Repair of double-strand breaks induced by CRISPR–Cas9 leads to large deletions and complex rearrangements, un lavoro di genetisti del britannico Wellcome Sanger Institute, che hanno compiuto una mappatura sistematica del genoma di cellule di topi e di uomini su cui si era intervenuti con editing mediante CRISPR/Cas9 e ritengono che le mutazioni non volute indotte nel DNA siano molte di più di quanto si pensasse (o sperasse).

Per chi volesse capire meglio e si sentisse bloccato davanti ai tecnicismi dell'articolo di Allan Bradley e colleghi, due articoli ripercorrono anche la storia del lavoro della Columbia University che abbiamo seguito fra maggio 2017 e la primavera scorsa:

- su Science Alert, Peter Dockrill: CRISPR Could Be Causing Extensive Mutations And Genetic Damage After All,

- e soprattutto su Stat, Sharon Begley: Potential DNA damage from CRISPR has been ‘seriously underestimated,’ study finds.

I titoli delle aziende attive nel settore hanno subito un immediato tracollo, ad esempio la svizzera CRISPR AG ha perso oggi l’8.6%, Editas Medicine ha perso il 7.5% e Intellia Therapeutics il 9.6% - riferisce GoInPharma.


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MessaggioInviato: martedì 17 luglio 2018, 9:50 
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Iscritto il: domenica 26 febbraio 2017, 22:44
Messaggi: 999
Località: Milano
Dora ha scritto:
La storia infinita dei possibili danni non intenzionali che le CRISPR possono indurre nel genoma vede oggi un nuovo capitolo, con la pubblicazione su Nature Biotechnology di Repair of double-strand breaks induced by CRISPR–Cas9 leads to large deletions and complex rearrangements, un lavoro di genetisti del britannico Wellcome Sanger Institute, che hanno compiuto una mappatura sistematica del genoma di cellule di topi e di uomini su cui si era intervenuti con editing mediante CRISPR/Cas9 e ritengono che le mutazioni non volute indotte nel DNA siano molte di più di quanto si pensasse (o sperasse).

Per chi volesse capire meglio e si sentisse bloccato davanti ai tecnicismi dell'articolo di Allan Bradley e colleghi, due articoli ripercorrono anche la storia del lavoro della Columbia University che abbiamo seguito fra maggio 2017 e la primavera scorsa:

- su Science Alert, Peter Dockrill: CRISPR Could Be Causing Extensive Mutations And Genetic Damage After All,

- e soprattutto su Stat, Sharon Begley: Potential DNA damage from CRISPR has been ‘seriously underestimated,’ study finds.

I titoli delle aziende attive nel settore hanno subito un immediato tracollo, ad esempio la svizzera CRISPR AG ha perso oggi l’8.6%, Editas Medicine ha perso il 7.5% e Intellia Therapeutics il 9.6% - riferisce GoInPharma.


Diciamo che era prevedibile che potessero verificarsi questo tipo di controbattute (o faide?)...comunque la voglio prendere semplicemente come l'occasione di capire sempre meglio tutti gli aspetti di questo metodo molto affascinante (e sicuramente con molti lati oscuri) e che necessita piuttosto di tantissima ricerca e non di battute d'arresto (spero...)

grazie cara!

_________________
Una pianificazione attenta non sostituirà mai una bella botta di culo!


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